Selgitatud: B.1.617 variant ja Covid-19 tõus Indias

Genoomi sekveneerimise andmed on näidanud 'topeltmutandi' olemasolu 61% Maharashtra proovidest. Kuid kas see uus variant põhjustab India jätkuvat tõusu, saab öelda alles pärast seda, kui on saadaval rohkem andmeid.

Tervishoiutöötajad valmistavad voodeid ette New Delhis asuvas Shehnai banketisaalis, mis on muudetud Covid-9 patsientide ajutiseks palatiks. (Ekspressfoto: Amit Mehra)

Eelmisel nädalal Maharashtra linnaosa laboritega peetud kohtumisel jagas riiklik viroloogiainstituut (NIV) piiratud andmeid, mis näitasid 361 genoomiga järjestatud proovi, mis koguti selle aasta jaanuarist märtsini, lagunemist.

Pealkirja leidmine alates analüüs : topeltmutatsiooni olemasolu tuvastati 220 - peaaegu 61 protsendis - proovidest. See topeltvariant klassifitseeriti eelmisel nädalal B.1.617 variandiks.

Infoleht| Klõpsake, et saada oma postkasti päeva parimad selgitused

Mis on B.1.617?

SARS-CoV-2 variandil B.1.617 on kaks mutatsiooni, E484Q ja L452R. Mõlemat leidub eraldi paljudes teistes koroonaviiruse variantides, kuid Indias on neist esimest korda teatatud.

Need kaks mutatsiooni on leitud viiruse piigivalgust. Teravalk aitab viirusel seonduda inimese raku retseptoritega ja pääseda peremeesrakku.

E484Q mutatsioon on sarnane E484K mutatsiooniga, mis on leitud koronaviiruse Ühendkuningriigis (liin B.1.1.7) ja Lõuna-Aafrikas (B.1.351).

L452R mutatsioon on leitud Californias kiiresti levivates variantides (B.1.427 ja B.1.429). See võib suurendada ACE2 retseptoritega spike-valkude seondumisvõimet inimese rakkudes, muutes selle ülekantavamaks. L452R võib samuti potentsiaalselt suurendada viiruse replikatsiooni.

Üheskoos on E484Q ja L452R nakkavamad ja võivad vältida antikehade teket.

Kust B.1.617 leiti?

Andmed on piiratud. Esimest korda teatati sellest Maharashtrast. Jaanuaris sekveneeriti 19 proovi erinevatest piirkondadest ja B.1.617 leiti neljast. Veebruaris sekveneeriti 234 proovi 18 ringkonnast ja 151 proovil – vähemalt 16 ringkonnast – oli see variant. Ja märtsis oli see 94 proovist koguni 65-l.

Siiani on Amravati, Nagpuri, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabadi ja Chandrapuri piirkond esitanud kindlaid tõendeid B.1.617 esinemise kohta. Teistes piirkondades sekveneeriti vähem proove ja mõnes leiti variant. Rohkemate proovide jaoks on järjestamine ootel.

LIITU NÜÜD :Express Explained Telegrami kanal

Kas see variant on virulentsem?

Seni puuduvad tõendid. Enamik patsiente saab hakkama koduse isoleerimisega, kuigi teaduslike tõendite saamiseks tuleb kliinilist kogemust kombineerida genoomi sekveneerimise andmetega. Arstide kliinilised anekdoodid viitavad sellele, et variant levib kiiremini, on nakkavam, võib nakatada terveid perekondi, kuid on vähem virulentne ega põhjusta dramaatiliselt rohkem haiglaravi.

Enamik patsiente on asümptomaatilised ja see on hea näitaja. Kuid absoluutarvudes on nii paljud juhtumid tervise infrastruktuurile koormanud, ütles dr Shashank Joshi, Maharashtra Covid Task Force'i ekspert.

Kui palju see on levinud?

Riikliku haiguste tõrje keskuse (NCDC) direktor dr Sujeet Singh on juhtinud tähelepanu sellele, et Maharashtrast on seni sekveneeritud väga vähe proove ja on liiga vara teha lõplikke järeldusi topeltmutandi leviku kohta. Keskvalitsus oli aga märtsis teatanud, et Maharashtras oli see variant 15–20 protsendil proovidest; viimaste järjestusandmete põhjal teame, et see arv on praegu üle 60 protsendi.

Maharashtra arstid ja piirkonna administraatorid teatavad, et erinevalt esimesest lainest nakatuvad teises laines terved pered. See võib viidata sellele, et füüsiline distantseerimine ja isolatsioonimeetmed on leibkonnas ebapiisavad või viirus on muutunud levinumaks.

Kas B.1.617 võib põhjustada Covid-19 juhtumite jätkuvat tõusu?

Dr Gangandeep Kang, Vellore'i Christian Medical College'i mikrobioloogia professor, ütles, et 60,9 protsenti seda varianti sisaldavatest proovidest näitasid tõenäoliselt seost mutatsiooni ja hüppe vahel – täpse vastuse saamiseks on aga vähemalt 1 protsent Covid-19 proovidest. tuleb järjestada iga nädal. India testib praegu üle 1000 juhtumi päevas ja see tähendaks umbes 1000 genoomi järjestust iga päev.

Samuti peame vaatama, kui palju inimesi on inimene võimeline nakatama, ja RT-PCR tsükli läve. Peame tegema reaalajas jälgimise. Jaanuari andmetel on aprillis vähe väärtust, ütles dr Kang.

Dr Gautam Menon, Sonepati Ashoka ülikooli ja Chennai matemaatikateaduste instituudi professor, ütles: see, mis meil on, on viitav, kuid vajame rohkem genoomi järjestuse andmeid, et mõista, milline variant põhjustab uute nakkuste arvu erinevates osariikides. Et oletada, et juhtumite arvu suurenemine on tingitud sellest topeltmutandi variandist, peaks meil olema rohkem ajapunkte. Näiteks kui võiks öelda, et tuvastasime 30. märtsil proovides seda varianti 30 protsenti ja seejärel 14. aprillil 40 protsenti, siis see viitaks sellele, et haiguse levikut domineerib uus variant.

Ka dr Menon rõhutas vajadust suurema andmete läbipaistvuse järele. On võimalik, kuigi üha ebatõenäolisem, et juhtumid võivad olla seotud ka eelmise tüvega, ütles ta. Kui me ei tea, mil määral võib suurenemist seostada uue variandiga, ei saa me lõplikult kindlaks teha, kas COVID-ile sobiva käitumise leevenemine vanema tüvega põhjustas tõusu või on põhjuseks uue variandi suurenenud nakkavus.

Prof Vinod Scaria, CSIR-IGIBi juhtivteadur nõustus, et me ei saa lõplikult väita, et need variandid põhjustavad teise laine tõusu. Kuid tõendid viitavad sellele, et vähemalt mõnes osariigis on B.1.1617 põlvnemine ülekaalus ja see võib kaasa aidata juhtumite arvu suurenemisele, ütles ta. Seda põlvnemist määratlevad 15 geneetilist varianti, sealhulgas kuus piigivalgu varianti. Prof Scaria ütles, et kaks neist (E484Q ja L452R) on seotud immuunsüsteemi põgenemisega ja suurenenud nakkavusega.

Kas variant võib vaktsiinidest kõrvale hiilida?

Jällegi on andmed piiratud. Mõned inimesed on tõepoolest nakatunud pärast esimest annust, kuid andmed selle kohta, kas nende proovid saadeti genoomi sekveneerimiseks, puuduvad.

Teame, et Lõuna-Aafrika variant suudab immuunvastusest paremini põgeneda. Teame, et Ühendkuningriigi variant on kõige levivam. Kuid me ei tea B.1.617 kohta seni midagi, sest me ei pane kokku järelduste tegemiseks andmeid, ütles dr Kang.

Dr Menon rõhutas, et kuigi vaktsiinid ei aita nakatumist ära hoida, hoiavad need kindlasti ära raskeid haigusi ja surma. Eeldame, et see jääb paika ka uue variandi puhul. Ainus keskpikas kuni pikaajaline lahendus Covid-19-ga toimetulemiseks on inimeste vaktsineerimine.

Jagage Oma Sõpradega: