Selgitatakse: kui kiiresti uus koroonaviiruse tüvi levib? Kas see mõjutab vaktsineerimist?

Uus koroonaviiruse tüvi Ühendkuningriigis: India ja mitmed teised riigid on peatanud lennud Ühendkuningriiki ja sealt tagasi. Millised mutatsioonid on viinud muret tekitanud koroonaviiruse variandini? Kui kiiresti on see levinud? Ja kas see mõjutab vaktsineerimist?

Šveitsis Genfis asuvas Cointrini lennujaamas tühistati lennud Suurbritanniast 21. detsembril 2020. (Reutersi foto: Denis Balibouse)

Esmaspäeval India peatas kõik lennud Ühendkuningriigist ja Ühendkuningriiki kuni 31. detsembrini, keset muret a uus variant SARS-CoV-2, mis levib ja kasvab seal kiiresti. Ka mitmed teised riigid on peatanud Ühendkuningriigi lennud ja kehtestanud reisipiirangud.

Millised on need mured, mis põhjustavad reisipiiranguid?

Eelmisel nädalal selgus, et Lõuna- ja Ida-Inglismaal Covid-19 juhtude kiire kasvu põhjuseks on uus SARS-CoV-2 variant. Seda nimetatakse VUI-ks (uurimise all olev variant) 202012/01 või B.1.1.7 liiniks.

Viimastel päevadel oleme tänu oma maailmatasemel genoomsele võimekusele tuvastanud koroonaviiruse uue variandi, mida võib seostada kiirema levikuga Lõuna-Inglismaal, ütles Ühendkuningriigi tervishoiuminister Matt Hancock parlamendi alamkojale. 14. detsember. Ühendkuningriigi võimud on Maailma Terviseorganisatsiooni variandist juba teavitanud.

Public Health England (PHE) teatas, et 13. detsembri seisuga on tuvastatud 1108 selle variandi juhtumit, peamiselt Lõuna- ja Ida-Inglismaal. PHE teeb uurimise nimel koostööd partneritega ja kavatseb oma järeldusi järgmise kahe nädala jooksul jagada.

Milline variant on?

Selle variandi tuvastas genoomseire käigus COVID-19 Genomics UK (COG-UK), konsortsium, mis analüüsib Ühendkuningriigi genoomi järjestamise andmeid. COG-UK on globaalse Covid-19 andmebaasi GISAID suurim panustaja.

Variant on tingitud mitmetest mutatsioonidest uudse koroonaviiruse SARS-CoV-2 piigivalgus, aga ka mutatsioonidest RNA viiruse teistes genoomsetes piirkondades. Esialgne analüüs viitab sellele, et see on ülekantavam kui varem ringlenud variandid. COG-UK tuvastas, et üks neist mutatsioonidest on N501Y, spike-valgu piirkonnas, mis seondub inimese raku võtmevalguga, ACE2 retseptoriga. See oli märk sellest, et muudatused võivad teoreetiliselt põhjustada viiruse muutumist nakkavamaks. Konsortsiumi sõnul tehakse jõupingutusi, et kinnitada, kas mõni neist mutatsioonidest aitab kaasa leviku suurenemisele või mitte.

Mida me teame haiguse edasikanduvuse ja raskusastme kohta?

Pühapäeval ütles PHE, et kogu genoomi järjestamise, epidemioloogia ja modelleerimise andmed viitavad sellele, et uus variant levib kergemini kui teised tüved.

Samas rõhutati ka, et puuduvad tõendid selle kohta, et variant põhjustaks tõenäolisemalt raskeid haigusi või suremust. … Kuid me jätkame uurimist, et seda paremini mõista, ütles ta. Ta ütles, et suremus on mahajäänud näitaja ja ta jälgib seda lähinädalatel pidevalt.

PHE on öelnud, et ta ei tea veel selle leviku suurenemise mehhanismi. Teame, et mutatsioonid spike-valgus, viiruse selles osas, mis muudab selle nakkavaks, võivad muuta seda, kuidas viirus inimrakkudega suhtleb, öeldakse.

Ta ütles, et tõendid näitavad, et nakatumise määr geograafilistes piirkondades, kus see konkreetne tüvi on ringelnud, on kasvanud oodatust kiiremini ja modelleerimismaterjalid on näidanud, et sellel variandil on suurem ülekandekiirus kui teistel praeguses ringluses olevatel variantidel.

Uus koroonaviiruse tüvi Ühendkuningriigis: politseinik juhib liiklust Inglismaal Doveris suletud parvlaevaterminali sissepääsu juures esmaspäeval pärast Doveri sadama sulgemist. (AP foto)

Kui palju muret teeb suurem levivus?

18. detsembril teatas NERVTAG (New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group), mis nõustab Ühendkuningriigi valitsust uute ja tekkivate respiratoorsete viiruste põhjustatud ohu osas, ning teatas 18. detsembril, et uus variant võib suurendada haiguse paljunemise arvu kuni 0,93 võrra. . Ta ütles, et tal on mõõdukas kindlustunne, et uus variant näitab teiste variantidega võrreldes oluliselt paremat edastatavust.

Ekspertorgan jõudis aga järeldusele, et praegu ei ole piisavalt andmeid, et teha järeldusi suurenenud ülekandumise põhjuste, haigusjuhtude vanuselise jaotuse ja haiguse tõsiduse kohta. Ta on öelnud, et ligikaudu 1000 juhtumist on tuvastatud 4 surmajuhtumit, kuid selle surmajuhtumite määra võrdlemiseks võrreldavate andmekogumitega on vaja teha täiendavat tööd.

Mutatsioonide paiknemine piigiglükoproteiini retseptoriga seonduvas domeenis suurendab võimalust, et see variant on antigeenselt erinev varasematest variantidest. Selle variandiga 915 isiku hulgas on tuvastatud neli tõenäolist uuesti nakatumist, kuid selle uuesti nakatumise määra võrdlemiseks võrreldavate andmekogumitega on vaja teha täiendavat tööd.

Pühapäeval Euroopa Haiguste Ennetamise ja Tõrje Keskuse avaldatud ohuhinnangu kokkuvõttes öeldakse, et fülogeneetiline analüüs näitab, et klaster erineb algsest Wuhani tüvest 29 nukleotiidi asendusega. Kolm Taanist ja üks Austraaliast pärit järjestust, mis pärinevad 2020. aasta novembris kogutud proovidest, koonduvad Ühendkuningriigi variandiga, mis viitab tõenäoliselt rahvusvahelise leviku toimumisele, kuigi ulatus on teadmata, teatas ta.

Uus koroonaviiruse tüvi Ühendkuningriigis: Doveri sadam suletakse, kuna ELi riigid kehtestavad Ühendkuningriigist reisimise keelu. (Reutersi foto)

Kuid kas viirus pole varem muteerunud?

Kui viirus paljuneb ja inimpopulatsioonis ringleb, tekivad mutatsioonid looduslikult, globaalses fülogeneesis umbes üks kuni kaks mutatsiooni kuus.

Tegelikult ütleb COG-UK SARS-CoV-2 puhul, et spike-valgus on praegu umbes 4000 mutatsiooni. Variant D614G oli varem domineeriv tüvi, kuna see levis väga kergesti. Teine tüvi, mis pärines Hispaania põllumeestelt, 20A. EU1, levis suvel kiiresti üle Euroopa.

Uute mutatsioonide pideva esilekerkimise taustal on raske ennustada, kas mõni antud mutatsioon on esmakordsel ilmnemisel oluline. Nende olulisuse mõistmine võib olla võimalik eksperimentaalse töö põhjal, mis näitab seost mutatsiooni ja viiruse bioloogia peene muutuse vahel. Paljude tuhandete mutatsioonide kombinatsioonide mõju testimine võtaks aga märkimisväärselt aega ja vaeva, ütles COG-UK.

Kas see mõjutab vaktsiini väljatöötamist ja reageerimist?

Pühapäeval teatasid Ühendkuningriigi ametivõimud, et selle mõistmiseks tehakse esmajärjekorras täiendavaid laboritöid. Praegu puuduvad tõendid selle kohta, et Pfizeri vaktsiin ei kaitse inimesi uue tüve eest, ütles PHE.

Jagage Oma Sõpradega: