Selgitatakse: Mis on CT väärtus Covid-19 testis ja miks see oluline on?

Tsükli läviväärtus ilmneb koroonaviiruse RT-PCR testides ja määrab, kas inimesel on Covid-19 positiivne või mitte. Mil määral on see korrelatsioonis viiruskoormuse ja haiguse tõsidusega?

RT-PCR test tuvastab viiruse; Ct väärtus määrab võrdlusaluse, kas inimene tuleb lugeda positiivseks. (Ekspressfoto: Amit Mehra)

Erinevate teaduslike terminite hulgas, mille Covid-19 pandeemia on avaliku sõnavara osaks võtnud, on üks RT-PCR-testide 'Ct väärtus', mille abil tehakse kindlaks, kas patsient on Covid-19 suhtes positiivne.

See oli teemaks, mille Maharashtra valitsus saatis hiljuti India meditsiiniuuringute nõukogule (ICMR). Riik otsis selgust, kas on otstarbekas käsitleda inimest Covid-negatiivsena, kui Ct väärtus on üle 24 ja inimene on asümptomaatiline. Riigiametnikud ütlesid, et erinevates ICMR-i dokumentides on mainitud erinevaid Ct väärtusi ning isegi Niti Aayogi ja riikliku haiguste tõrje keskuse vahel olid erinevad seisukohad.

Päevi hiljem kirjutas ICMR-i peadirektoraat riigi tervishoiuministrile tagasi, et ICMR on kogu riigi viroloogialaboritelt panustanud, et jõuda ühtse Ct väärtuse piirini. ICMR ütles, et kõiki patsiente, kelle Ct väärtus on alla 35, võib pidada positiivseks, samas kui neid, kelle Ct väärtus on üle 35, võib pidada negatiivseks.

Aga mis on Ct väärtus?

Lühidalt tsüklilävi, Ct on väärtus, mis ilmneb RT-PCR-testide käigus, mis on SARS-CoV-2 koroonaviiruse tuvastamise kuldstandard. RT-PCR testis ekstraheeritakse RNA patsiendilt kogutud tampoonist. Seejärel muundatakse see DNA-ks, mis seejärel amplifitseeritakse. Amplifitseerimine viitab geneetilise materjali - antud juhul DNA - mitme koopia loomise protsessile. See parandab testi võimet tuvastada viiruse olemasolu. Amplifitseerimine toimub tsüklite seeria kaudu – ühest koopiast saab kaks, kahest neli ja nii edasi – ning pärast mitut tsüklit tekib tuvastatav kogus viirust.

ICMR-i soovituse kohaselt on RT-PCR reaktsiooni Ct väärtus tsüklite arv, mille jooksul PCR-produkti fluorestsents on tuvastatav lisaks taustsignaalile. Lihtsamalt öeldes viitab Ct väärtus tsüklite arvule, mille järel saab viirust tuvastada. Kui nõutakse suuremat tsüklite arvu, tähendab see, et viirus jäi avastamata, kui tsüklite arv oli väiksem. Mida madalam on Ct väärtus, seda suurem on viiruskoormus – kuna viirust on märgatud vähemate tsüklite järel.

Infoleht| Klõpsake, et saada oma postkasti päeva parimad selgitused

Miks on CT väärtus oluline?

Selle konteksti panemiseks vaadakem ICMR-i nõuannet ja Maharashtra kirja ICMR-ile. ICMR järgi loetakse patsient Covid-positiivseks, kui Ct väärtus on alla 35. Teisisõnu, kui viirus on tuvastatav pärast 35 tsüklit või varem, loetakse patsient positiivseks. Kui võrdlusalust langetaks 24-le – Maharashtra kirjas mainitud väärtusele –, tähendaks see, et Ct väärtusi vahemikus 25–34 ei peeta positiivseks. Võrdlusnäitaja 35 tähendab seega, et positiivseks loetaks rohkem patsiente, kui saaksime, kui võrdlusnäitaja oleks 24. ICMR on öelnud, et Ct läve parameetri alandamine võib viia mitme nakkusohtliku inimese kadumiseni.

Juhtiv viroloog dr Shahid Jameel ütles, et Ct väärtust võib pidada ülekandepotentsiaali mõõtmiseks. Nii et kui mu kurgus ja ninas on rohkem viirust, siis ma kannan seda paremini edasi, ütles dr Jameel, kes on Ashoka ülikooli Trivedi bioteaduste kooli direktor.

Mis on ICMR-i läve 35 tähtsus?

Ülemaailmselt on Covid-19 Ct väärtuse aktsepteeritud piirväärtus vahemikus 35–40, olenevalt vastavate testimisseadmete tootjate juhistest. ICMR on jõudnud Ct väärtuseni 35, tuginedes laborikogemustele ja mitmetest viroloogialaboritest saadud sisenditele.

Uut nõuannet ei olnud, kuid ICMR teavitas Maharashtra valitsust, et madalama tsükli läve parameetri kasutamine ei ole soovitatav, kuna see tooks kaasa mitme nakkusohtliku inimese kadumise ja suurendaks haiguste levikut, ütles ICMRi peadirektoraat dr Balram Bhargava.

Kas Ct väärtuse ja haiguse tõsiduse vahel on seos?

Ei. Kuigi Ct väärtus on pöördvõrdelises korrelatsioonis viiruskoormusega, ei mõjuta see haiguse tõsidust, on eksperdid öelnud. Patsiendil võib olla madal Ct väärtus, mis tähendab, et tema viiruskoormus on piisavalt kõrge, et seda kiiresti tuvastada, kuid ta võib siiski olla asümptomaatiline.

Selle aasta jaanuaris ajakirjas Indian Journal of Medical Microbiology avaldatud väikeses uuringus leiti, et Covid-19 haigusega patsientide Ct väärtuste ja haiguse tõsiduse või suremuse vahel ei olnud seost. Leiti, et sümptomite ilmnemisest möödunud ajal on haiguse raskusastmega võrreldes tugevam seos Ct väärtustega.

Ct väärtus räägib meile viiruskoormusest kurgus, mitte kopsudes, ütles Pune'i Deenanath Mangeshkari haigla nakkushaiguste konsultant dr Parikshit Prayag. Ct väärtus ei korreleeru raskusastmega – ainult nakkavusega. Esimeses aruandes ma tegelikult ei vaata Ct väärtust, kuid haiglas viibivate patsientide jälgimisel arvestan Ct väärtust, sest siis saan otsustada, kas viia patsient mitte-Covidi hoonesse või mitte. . Nakatuvuse seisukohast võib see olla oluline, mitte tõsidus, ütles dr Prayag.

Kas kõrge Ct väärtus tähendab alati madalat viiruskoormust?

Kuigi see võib olla ilmselge järeldus, rõhutavad mõned eksperdid, et mõnel patsiendil võib olla kõrge Ct väärtus, kuid siiski väga märkimisväärne Covid-19 nakkuse tase ja vastupidi. RT-PCR-testi tõlgendamisel on olulised paljud tegurid ning tulemused võivad sõltuda ka proovide võtmise meetodist ning nakatumisest kogumiseni ja analüüsini kuluvast ajast.

Eelmise aasta augustis avaldatud ICMR-i nõuanne märkis, et Ct väärtused sõltuvad proovi kogumise viisist. Halvasti kogutud proov võib kajastada sobimatuid Ct väärtusi. Peale selle määravad Ct väärtused ka testi läbiviija tehniline pädevus, seadmete kalibreerimine ja tõlkide analüüsioskus.

Jällegi võivad Ct väärtused samalt isikult kogutud nina- ja orofarüngeaalsete proovide vahel erineda. Transporditemperatuur ja aeg, mis kulub kogumisest kuni laborisse kättesaamiseni, võivad samuti negatiivselt mõjutada Ct väärtusi.

Jagage Oma Sõpradega: